Algunos flautistas de pico no pueden tocar estos instrumentos. Algunos tienen manos demasiado pequeñas para tocar la flauta contralto. Muchos, en especial personas mayores, tienen limitaciones en la agilidad en las manos, tienen desequilibrios de fuerza entre ambas manos o, incluso, les falta algún dedo. Puede haber muchos obstáculos que aparentemente hacen de la flauta de pico un instrumento demasiado difícil o incluso imposible de tocar. En estos casos el constructor puede ayudar desplazando los agujeros o añadiendo llaves especiales y así obrar milagros.
La flauta tenor es la que más problemas suele dar para tapar los agujeros. Es bastante fácil añadir llaves para el sol y el fa que simplifican el acceso del 3º dedo de la mano izquierda y el 1º dedo de la mano derecha y evitan tener que estirar demasiado la mano. Se pueden también encontrar soluciones para la flauta contralto.